中国合格评定国家认可委员会组织机构包括：全体委员会、执行委员会、认证机构技术委员会、实验室技术委员会、检查机构技术委员会、评定委员会、申诉委员会和秘书处。中国合格评定国家认可委员会委员由政府部门、合格评定机构、合格评定服务对象、合格评定使用方和专业机构与技术专家等5个方面，总计63个单位组成。
2021年2月1月，中新网消息，中国合格评定国家认可委员会(CNAS)科研实验室专业委员会日前在北京成立。
中国合格评定国家认可制度已经融入国际认可互认体系，并在国际认可互认体系中有着重要的地位，发挥着重要的作用。原中国认证机构国家认可委员会（CNAB）为国际认可论坛（IAF）、太平洋认可合作组织（PAC）正式成员并分别签署了IAF MLA（多边互认协议）和PAC MLA，原中国实验室国家认可委员会（CNAL）是国际实验室认可合作组织（ILAC）和亚太实验室认可合作组织（APLAC）正式成员并签署了ILAC MRA（多边互认协议）和APLAC MRA。
体系认证机构认可部
1.负责管理体系认证、人员认证、软件评估等认可制度和方案研究，及相关领域工作组的牵头管理工作；
2.组织相关机构认可申请受理、评审以及后续的监督、扩项和复评活动，并实施监控。承担部分现场评审工作；
3.负责审查评审材料的完整性和符合性，提交认可评定；
4.负责认证信息的统计与分析，认证机构变更信息的收集和处理，以及认可费用收缴管理工作；
5.负责认证机构专门委员会及相关专业委员会的管理工作；
6.承担对评审员/技术专家进行培训、监督和评价的有关工作；
7.完成中心领导交办的其他工作。
特殊标准实验室认可部
1.负责医学、生物、司法鉴定、能力验证提供者、标准物质/标准样品生产者、实验动物、科研、生物样本库等特殊标准认可制度和方案研究，及相关领域工作组的牵头管理工作；
2.组织实施医学、生物、司法鉴定、能力验证提供者、标准物质/标准样品生产者、实验动物、科研、生物样本库等实验室和机构认可申请受理、评审以及后续的监督、扩项和复评活动，并实施监控。承担部分现场评审工作；
3.负责建设和维护能力验证资源平台；组织参加国际能力验证计划。
4.负责审查评审材料的完整性和符合性，提交认可评定；
5.负责相关专业委员会的管理工作；
6.承担政府委托的资质认定，以及政府、行业和社会委托的能力验证、良好实验室规范等技术评价工作；
7.承担对评审员/技术专家进行培训、监督和评价的有关工作；
8.完成中心领导交办的其他工作。