航空运输方法按不同标准有不同分类，最常用的是按运作方式分为班机运输、包机运输、集中托运、航空快递（航空急件传送）这四种。
按运作方式分类
班机运输：定期开航、固定航线、固定始发站和目的站，能确切掌握起运和到达时间，适合时效性强的小件、高价值或鲜活货物。
包机运输：租用整架飞机或部分舱位，按双方商定条件运货，运费通常比班机低，但活动范围较小，适合大宗货物。
集中托运：货运代理把多批零星货物集中成一批向航空公司托运，统一运抵目的地后再分发给各收货人，能争取到更低的运价，也省去货主自行办理托运的繁琐。
航空快递（航空急件传送）：即航空快递，特别适用于急需物品、医疗器械、贵重物品、图纸资料、关键零部件、货样、单证等小件物品的快捷运输。
另外还有货到付款方式（承运人代发货人向收货人收取货款）和集装箱运输方式（提高运输效率、节约包装），后者更多是货物装载形式而非独立的运输方式。
按运输性质分类
国内航空运输：出发地点、经停地点和目的地点均在中华人民共和国境内。
国际航空运输：出发地点、经停地点和目的地点之一不在中华人民共和国境内。
按运输对象分类
分为航空旅客运输、航空旅客行李运输和航空货物运输三类。其中航空邮件运输属于特殊的航空货物运输，一般优先运输。
按经营形式分类
航空运输企业经营形式主要有班期运输、包机运输和专机运输，通常以班期运输为主，后两种按需要临时安排。
简单来说，日常接触最多的是班机运输和航空快递；大批量货物可考虑包机或集中托运来降低成本。